Помимо международной деятельности и постоянной работы над расширением и повышением качества материально-технической базы и методического обеспечения филиал осуществляет качественную подготовку своих курсантов и студентов по четырём специальностям среднего профессионального образования (очная форма обучения):
- «Судовождение» (срок обучения – 5 лет);
- «Эксплуатация судовых силовых установок»;
- «Эксплуатация судового электрооборудования и средств автоматики»;
- «Судостроение» (срок обучения – 4 года).
На факультете высшего образования готовят будущих моряков и береговых работников водно-транспортной отрасли по шести специальностям и направлениям подготовки (очная форма обучения):
- «Судовождение»;
- «Эксплуатация судовых силовых установок»;
- «Эксплуатация судового электрооборудования и средств автоматики» (специалитет, срок обучения – 5 лет и 6 месяцев);
- «Управление водным транспортом и гидрографическое обеспечение судоходства»;
- «Кораблестроение, океанотехника и системотехника объектов морской инфраструктуры»;
- «Технология транспортных процессов» (бакалавриат, срок обучения – 4 года).
На факультете ВО и СПО по всем названным специальностям и направлениям подготовки обучение ведётся по очной и заочной формам.
На базе управления конвенционной подготовки и повышения квалификации осуществляется обучение по более чем 120 программам дополнительного профессионального образования для курсантов филиала и членов экипажей судов Российского флота и стран Прикаспия.